开发手游软件主要使用的版本有以下几种：

Unity3D 5.0

Unity3D是目前最流行的手机游戏开发引擎之一，支持2D和3D游戏开发，使用C语言进行编程。它具有强大的图形渲染能力和易于使用的开发工具，支持多种平台，包括iOS和Android。

Unreal Engine 4 v4.5

Unreal Engine是一款流行的游戏开发引擎，具有强大的图形渲染能力和物理模拟功能。它支持多种平台，包括iOS和Android，通常用于开发高质量的3D手机游戏。

Cocos2d-x

Cocos2d-x是一个开源的跨平台游戏引擎，主要用于开发2D手机游戏。它支持多种编程语言，如C++和Lua，并提供了丰富的功能和工具。

GameMaker Studio 2

GameMaker Studio是一款易于上手的游戏开发工具，适用于开发2D手机游戏。它提供了图形化的开发界面和简单的脚本语言，使开发者可以快速创建游戏。

Corona SDK

Corona SDK是一款基于Lua语言的跨平台游戏开发工具，适用于开发2D手机游戏。

根据以上信息，目前手游开发主要使用的版本包括Unity3D 5.0、Unreal Engine 4 v4.5、Cocos2d-x、GameMaker Studio 2和Corona SDK。开发者可以根据自己的需求和技能选择合适的引擎和版本进行游戏开发。