《尼尔》手游的剧情主要围绕着一个名为“牢笼”（Cage）的神秘世界展开。玩家将扮演一名“白色少女”，在这个充满谜团和危险的地方寻找某个特定的事物，同时被一个名为“妈妈”的神秘生物所引导。剧情的发展包括主线剧情和武器故事，通过这些故事，玩家可以更深入地了解游戏的世界观和角色背景。

游戏的故事舞台是一个被称为“牢笼”的地方，这个名字来源于一座大型高塔，其中包含了许多建筑物和巨大生物的栖息地。玩家需要在这个复杂的环境中展开冒险，寻找失去的东西并寻求赎罪。

此外，《尼尔》系列以其独特的剧情设定和深刻的哲学思考而著称。游戏中的角色命名多源于哲学家，暗示着作品对哲学问题的关注。玩家在游戏中会不断思考机器人的存在意义，它们被创造出来却拥有自身的意识和情感，那么它们究竟算是什么呢？。

综合来看，《尼尔》手游的剧情通过操纵“白色少女”和“妈妈”在“牢笼”中的冒险，展开了一系列充满谜团和哲学思考的故事。