房在线软件的收费模式如下：

首家门店免费：

房在线软件的第一个门店是永久免费的，不收取任何费用。

第二个门店及以后收费：

从第二个门店开始，房在线软件开始收费。收费的门店第一年需要支付2000元，第二年开始则只需支付800元/门店的服务费。

其他增值服务：

房在线还提供各种付费增值产品，例如房源采集推送软件——房蚁、房产合同软件——签单宝、房产小程序——微官网等。中介公司可以根据自身需要选择服务的产品和项目。

系统升级免费：

房在线软件系统会持续升级，新版本更新完全免费。

其他费用：

关于微官网等特定功能，可能会有额外的收费，具体费用可咨询产品顾问或拨打官方电话。

综上所述，房在线软件的收费主要集中在第二个门店及以后的年度服务费上，首个门店免费且享受所有基本功能。建议房产中介公司在选择使用房在线软件时，详细了解其增值服务和额外费用，以便做出更合适的选择。