刷机时保留软件的方法有以下几种：

使用第三方工具备份数据

在刷机前，可以使用如360手机助手、刷机精灵等第三方工具将手机中的数据备份到电脑上。这些工具通常支持备份应用程序数据和设置，从而在刷机后能够恢复这些数据。

手动备份软件安装路径

如果知道各个软件的安装路径，可以手动备份这些安装路径。在刷机后，重新安装这些软件并指定之前备份的安装路径即可恢复。

使用云服务备份

可以利用云服务如Google Drive、OneDrive等，将手机中的数据备份到云端，然后在刷机后从云端恢复数据。这种方法适用于备份整个手机数据，包括已安装的软件及其数据。

使用钛备份

钛备份是一款强大的数据备份工具，可以在刷机前备份所有应用程序及其数据，并在刷机后恢复这些数据。需要注意的是，使用钛备份后可能需要重新安装部分应用程序并进行验证。

苹果设备

对于苹果设备，可以使用iTunes在刷机前进行备份，刷机后再通过iTunes恢复备份，这样可以保留所有数据和已安装的应用程序。

建议

备份重要数据：在刷机前，务必备份所有重要数据和应用，以防刷机过程中发生意外导致数据丢失。

选择合适的备份工具：根据个人需求和设备类型，选择合适的备份工具和方法，确保备份过程顺利且数据能够完整恢复。

注意备份路径：手动备份软件时，注意记录每个软件的安装路径，以便在刷机后能够准确恢复。

通过以上方法，可以在一定程度上确保刷机过程中软件和数据的安全。