在山东申请软件著作权，可以遵循以下步骤：

填写申请表

在中国版权保护中心网站上进行用户注册并登录。

在线填写软件著作权登记申请表，并确认、提交及打印。

准备申请文件

软件著作权登记申请表。

软件的鉴别材料，包括软件程序和文档。通常需要提供3000行源代码（不包含空行），源代码前30页和后30页，每页不少于50行，不足60页的提交全部。此外，还需提供详细的操作手册或设计说明，包括登录界面、操作步骤截图、软件界面截图、软件结构图、各个功能的流程图、逻辑框架图等。

申请人身份证明文件，如法人营业执照副本复印件、事业单位法人证书副本的复印件或其他民政部门或工商管理部门出具的证明文件复印件，或个人身份证复印件（正反面）。

联系人身份证明文件、权利归属证明文件及其他证明文件，如委托合同、合作开发合同等。

缴纳申请费

文件符合受理要求后，软件登记机构会发出缴费通知，申请人或代理人需按照通知要求缴纳费用。

提交申请

将所有申请文件提交至国家版权局或山东省版权局指定的地址。

审核与发证

国家版权局将对申请材料进行审核，审核通过后，将颁发软件著作权证书。

领取证书

审核通过后，可以按通知领取软件著作权证书。如果选择到登记受理大厅领取，应在受理之日起30个工作日后，持受理通知书原件领取。

建议在申请前，充分了解国家版权局关于软件著作权的相关政策和规定，确保申请过程顺利进行。同时，确保所提供的申请材料真实有效，保护源代码安全，防止泄露。