开发软件的企业税务处理涉及多个税种，包括增值税、企业所得税和个人所得税等。以下是一些关键的税务处理方法和策略：

增值税

税率：软件开发企业主要涉及软件产品销售和技术服务等增值税业务，增值税的税率通常为6%。

即征即退政策：符合条件的软件企业可以享受即征即退政策，即增值税实际税负超过3%部分实行即征即退。

企业所得税

税率：企业所得税的税率通常为25%，但符合条件的高新技术企业可以享受15%的优惠税率。

高新技术企业认定：为享受企业所得税优惠政策，软件开发企业需要通过高新技术企业认定，并满足研发费用占收入比例、核心技术团队等相关要求。

研发费用加计扣除：软件企业的研发费用可以享受加计100%扣除的优惠政策。

两免三减半政策：自获利年度起，第一年至第二年免征企业所得税，第三年至第五年按照25%的法定税率减半征收。

个人所得税

代扣代缴：软件开发企业需要为员工代扣代缴个人所得税，主要涉及工资薪金所得和劳务报酬所得。

其他税种

印花税：在企业的日常经营中，合同、账簿等文件可能需要缴纳印花税。软件开发企业通常涉及的印花税税目包括购销合同、技术合同、财务账簿等。

税务筹划与优化

税收返还：企业可以选择有税收优惠政策的地方注册分公司或新公司，采取“业务分包”的方式分流主体公司的部分业务利润，从而享受税收返还。

核定征收：在税收优惠园区注册个人独资企业，申请核定征收，免征企业所得税，直接核定个税0.5%-2.1%，综合税率1.56%-3.16%。

业务分包：通过个人独资企业与主体公司进行业务往来，即业务分包的形式，把主体企业利润分包至可以享受核定征收的个人独资企业，实现合理合规节税。

注意事项

合法合规：企业应严格按照税法要求，准确申报各项税款，避免税务风险。

税务筹划：企业应定期进行税务筹划，以确保最大限度地享受税收优惠。

证书与记录：软件公司销售自行开发生产的软件产品，需要取得软件产业主管部门颁发的《软件产品登记证书》或著作权行政管理部门颁发的《计算机软件著作权登记证书》，经主管税务机关审核批准后，方可享受增值税即征即退政策。

通过以上策略和方法，开发软件的企业可以有效地进行税务筹划和优化，降低税负，提高企业的整体盈利能力。