计算机软件公证取证主要有以下几种方式：

购买盗版软件并封存

权利人与公证机关工作人员一起作为购买者购买盗版软件，并对所购软件进行封存以及对整个购买过程进行公证。这种方式在民事侵权诉讼中，如果没有相反的证据，一般都能够得到确认。

行政执法手段

在公证机关工作人员无法进入的侵权地，可以通过版权局对侵权地进行查处，对于行政执法机构已经认定的侵权行为，在没有相反的证据情况下，法院都予以直接认定。

在线录屏或公证取证

权利人可以通过在线访问目标服务器，进行过程取证，将访问的结果文件及取证过程录屏保存。同时，可以将证据包的hash值上传至区块链进行交易，以证明证据自固定之时起未被篡改。

使用可信时间戳电子证据平台

申请人可以通过可信时间戳电子证据平台进行录屏取证，平台会录制整个取证操作过程，并对录制的视频文件进行可信时间戳固化，从而确保证据的真实性和有效性。

软件指纹分析和系统日志审查

利用专业软件分析工具，对涉嫌侵权的计算机系统进行深入分析，通过提取软件的特定特征码或指纹，与正版软件的特征码进行比对，以识别是否存在未经授权的副本。此外，检查系统日志文件，分析软件的安装、运行和使用记录，以确定软件是否被非法安装或使用。

第三方审计工具

使用第三方软件审计工具，这些工具通常具备自动化的检测和报告功能，能够快速识别出未经授权的软件使用情况。

在进行计算机软件公证取证时，建议尽量聘请专家或专业计算机软件侵权律师参与取证，以增加证据的证明力。同时，确保取证过程合法合规，避免任何形式的干扰和不合法操作，以确保证据的有效性和法律效力。