查重软件识别引用的方式主要有以下几种：

文本匹配算法：

查重软件通过先进的文本匹配算法，比对待检测文本与数据库中的内容，识别出相似的部分。这些算法可以分析文本中的关键词、短语和句子结构等信息，从而识别出引用的文献来源。

引用格式识别：

查重软件通常能够识别常见的引用格式，如APA、MLA、Chicago等，并根据这些格式判断引用内容是否符合规范。

上下文分析：

查重软件会查看引用内容前后的文字，判断其是否在进行论述、解释或与引用内容相关的讨论。如果有合理的衔接和解释，系统会更容易确认这是引用。

文献数据库比对：

查重软件会利用其庞大的数据库资源，将待检测的文本与数据库中的文献信息进行比对，判断其所属的领域和类型。

特殊标识：

一些查重软件会在识别出引用后，用特殊的标识（如绿色）显示引用部分，以便用户可以快速识别。

语义分析：

先进的查重系统会运用语义分析技术，不仅关注字词的匹配，还会深入理解文本的含义和逻辑关系，以更准确地判断引用内容的合理性和准确性。

引用比例和分布：

查重系统还会考虑引用内容在论文整体中的比例和分布。如果某一部分集中出现大量相似的引用，可能会引起系统的特别关注，进行更细致的分析判断。

为了确保引用内容的正确性，避免查重问题，建议采取以下措施：

正确使用引用格式：按照所要求的引用格式正确标注引用内容。

适当引用：引用内容不能太少，应引用整段或句子，以便查重系统能够精准地检测到引用的文献内容。

避免修改引用内容：确保引用的内容与原文一致，避免因修改导致查重系统无法识别引用。

通过以上方法，可以有效地帮助查重软件识别引用，降低重复率，提高论文的原创性。