在Linux操作系统中，软件的工作方式主要涉及以下几个方面：

文件权限

Linux系统中的程序文件需要具有可执行权限才能运行。可以使用`chmod`命令来修改文件的权限，例如添加可执行权限`+x`。

命令行执行

用户可以通过在终端中输入程序名称来直接运行程序。如果程序位于当前目录，可以直接输入文件名；如果不在当前目录，需要提供文件的绝对路径。

包管理器

Linux中的许多软件以源代码形式发布，但编译过程复杂。因此，软件开发者通常会将编译好的二进制文件打包成软件包，用户可以通过包管理器（如`apt`、`yum`、`pacman`等）来安装、卸载、更新和检查软件包。

环境变量

环境变量用于设置程序的运行时环境。用户可以通过`export`命令来设置环境变量，例如`export PATH=$PATH:/path/to/software`，这样设置会影响当前用户的所有程序运行。

系统路径

Linux系统通过环境变量`PATH`来查找可执行文件。用户可以通过修改`PATH`变量来添加新的软件路径，使系统能够找到并执行这些程序。

用户和权限

Linux系统将运行状态分为用户态和内核态，用户态是应用程序的工作状态，而内核态是Linux内核运行时的状态。用户可以通过`sudo`命令以root用户身份运行程序，但需要输入root密码。

中断和堆栈机制

Linux操作系统基于存储程序计算机模型，程序指令保存在存储器中，处理器从存储器中获取指令并执行。中断机制是现代多任务操作系统的基础，处理器在收到中断信号后会从存储器的固定位置取指令执行。

内核功能

Linux内核负责进程调度、信号处理、中断处理等核心功能。内核通过中断机制和堆栈机制实现多任务处理，确保系统的稳定性和安全性。

综上所述，Linux软件的工作方式涉及文件权限管理、命令行执行、包管理器、环境变量和系统路径配置、用户权限管理以及内核功能等多个方面。这些机制共同协作，使得Linux系统能够高效、稳定地运行各种应用程序。