软件咨询的收费方式通常基于以下几个关键因素：

服务内容：

根据客户所需咨询的具体内容，软件咨询公司会进行评估，这包括所需的人员技术水平、服务所需的时间周期等，这些都会影响最终的收费。

项目复杂度：

对于复杂的软件开发或优化项目，收费可能更为复杂，可以采用按阶段收费或按项目成果收费的方式。

服务时长：

时间计费模式通常根据项目复杂度和所需时间来计算费用。

项目结果：

按项目结果计费模式则根据项目的实际效果和客户满意度来收费。

市场供需关系：

市场供需关系也会对收费标准产生影响。

团队规模和成员经验：

开发团队的规模、成员的技术水平以及专业经验也是决定收费标准的重要因素。

其他因素：

还包括客户的具体需求、预期收益、实施周期等，这些因素也会影响咨询费用的制定。

常见的收费模式包括：

固定价格模式：适用于明确、简单的咨询任务，客户可以在项目开始前就确定预算。

时间计费模式：根据开发人员的工作时间或项目总时长来计算费用，适合需求不明确或需要持续迭代的项目。

按项目结果计费模式：根据项目的实际效果和客户满意度来收费，适用于需求稳定、变动较少的项目。

按小时收费：根据开发人员的工作时间来计算费用，适合需求不明确或需要持续迭代的项目。

按项目收费：根据整个项目的规模和复杂性来确定一个总价，适用于需求明确、范围清晰的项目。

按月收费：一般适用于长期合作项目，客户可以在项目开始前就确定预算。

在实际操作中，软件咨询公司可能会结合多种收费模式，根据项目的具体情况和客户的需求来制定灵活的收费方案。此外，为了确保收费的合理性和透明度，咨询公司通常会在咨询合同中明确服务内容、费用构成和服务标准等条款。