软件企业认证证书的流程一般如下：
注册
企业需要在软件行业协会的网站上进行注册，填写公司名称、地址、组织机构代码、电话、联系人等信息。
注册审核
软件行业协会将在1-2天内对注册信息进行审核，审核通过后，企业可以进行下一步的申报。
填报软件企业认定申请表
注册通过审核后，企业需要在网上填报软件企业认定申请表，并上传相关模板表格，如软件收入清单和大专人员名单等。
等待审核
软件行业协会将在2-3天内对申报材料进行审核，审核通过后，企业需要预约交材料。
初审通过，等待发证
在预约的时间递交材料后，审查人员审核通过后，将发放受理通知单，企业可以在通知单上注明的时间在网上查看，审核通过后可以领取软件企业证书。
此外，如果是申请CMMI认证，流程如下：
了解CMMI认证
企业需要了解CMMI认证标准、评估和认证机构，阅读CMMI模型、标准和认证工作流程，选择符合自己要求的机构。
评估内部状况
企业需要根据CMMI认证标准，评估自己的管理和开发过程、质量控制标准、文档记录等要素，找出需要提升和改进的方面。
制定改进计划
根据评估结果，企业需要制定改进计划，确定措施，合理规划时间和资源，明确改进的目标和期望效果。
内部认证
企业进行内部评估和审查，确保CMMI的实施标准符合标准和需要，并能顺利应对评审和认证过程中的问题。
申请认证
企业确认自己符合最低申请要求，准备所有必要的材料，包括工程和项目管理文档、流程规程文档、员工培训证明等，并向CMMI认证机构提交申请。
现场审核
认证机构批准申请后，将组织现场审核并进行现场访问，审核员将评估企业的流程实际应用情况，并建议是否授予认证。
通过认证
审核员提交审核报告，认证机构对审核报告进行审核，审核通过后，颁发CMMI认证证书。
对于双软企业认证，流程如下：
软件著作权登记
在北京国家版权中心提供相关资料进行登记。
软件评测
提供软件著作权说明文档，填写《软件测试表》进行软件评测。
双软认证
在当地软件行业协会办理双软认证，提交相关材料。
准备认证材料
准备企业营业执照副本复印件、资产负债表、损益表、现金流量表、软件收入发票及合同、科研费用明细账、大专以上人员名单信息、计算机软件著作权登记证书等材料。
提交认证申请
向软件行业协会提交软件企业认定申请，包括软件企业认定申请表、企业上一年度财务报表、人员配置及学历构成、软件开发环境和企业经营情况等内容。
审核与发证
软件行业协会审核材料，审核通过后，企业可以领取软件企业证书。
建议企业在申请软件企业认证证书时，详细阅读并了解相关认证标准、流程和要求，确保准备的材料完整、准确，以提高认证通过的概率。
