软件出口的处理方式主要分为 海关通关方式和 网上传输方式两种。以下是具体的处理步骤和所需材料：

海关通关方式

在线登记：在双方合同正式生效后，企业需前往“软件出口合同登记管理中心”进行在线登记，并领取《软件出口合同登记证书》。

报关手续：正式开始报关手续时，需要提供《软件出口合同登记证书》、《软件出口合同》（正本）、《出口收汇核销单》（外汇管理局发放）等单证。

收汇核销：企业完成收汇后，银行会根据要求出具《出口收汇核销专用联》。企业需凭借相关单证到外汇管理局办理出口收汇核销手续，外汇管理局会出具《出口收汇核销单退税专用联》。

退税手续：符合退税条件的企业可以凭借相关单证到当地税务局办理出口退税手续，税务局核查无误后予以办理。

网上传输方式

在线登记：企业同样需要先行领取《软件出口合同登记证书》。

银行手续：后续银行办理结汇或入账手续时，企业需要提供《软件出口合同登记证书》及《软件出口合同》。

收汇证明：企业需出具《软件出口已收汇证明》。

注意事项：

合同明确：软件出口企业在合同中应明确采取“海关通关方式”或“网上传输方式”。

免税政策：根据财税【2012】39号文和《财政部 国家税务总局关于出口货物劳务增值税和消费税政策的通知》，软件产品出口适用增值税免税政策，进项税额必须进行转出处理。

合同备案：无介质进口的软件需办理合同备案以便统计和收付汇。

特许权使用费：软件进口经常会涉及到特许权使用费，申报前需确认清楚。

建议：

详细了解政策：企业应详细了解相关政策和法规，确保在出口过程中符合要求。

选择合适的出口方式：根据实际需求选择“海关通关方式”或“网上传输方式”，并确保所有相关手续和单证齐全。

注意免税和退税：软件出口享受增值税免税政策，企业需注意进项税额的转出处理，并在符合条件的情况下办理出口退税。