南威软件与华润数科在2022年8月2日签署了《战略合作协议》，华润数科成为南威软件的控股股东。双方本着“项目合作、技术推动、相互促进、共同提高”的原则，在智慧城市、数字政府、公共安全、城市治理、企业数字化、工业互联网等方面进行深入合作。华润数科将结合其在华润云、数字企业、消费互联网、数字能源、数字金融等领域的优势，与南威软件在一网通办、一网统管、一网协同和电子身份证等方面的优势，共同开发适应市场需求且极具竞争力的数字政府、数字经济、数字社会产品，实现面向政府、企业、个人的城市数字运营，形成全面战略合作伙伴关系，并致力于成为领先的数字经济服务商。

然而，到了2024年5月，南威软件与华润数科签订的《股份转让协议》和《表决权放弃协议》被终止，这意味着华润数科不再是南威软件的控股股东。这一变动可能与南威软件的经营业绩有关，根据公开信息，南威软件在2023年一季度和三季度的业绩均出现了下滑。

综上所述，南威软件与华润数科曾有过紧密的合作关系，华润数科一度成为南威软件的控股股东，但这一关系已经终止。