软件公司计算税收的过程涉及多个税种和步骤，具体如下：

增值税计算

一般计税方法：适用于大多数企业，企业需按销售额的增值部分计算增值税。具体来说，企业在销售软件时，根据销售价格计算应缴纳的增值税，同时可以抵扣在购买原材料、支付服务等环节中已支付的增值税。这意味着，企业需定期进行进项税和销项税的记录与核算。

简易计税方法：适用于小规模纳税人，税率通常较低，企业不需要进行进项税抵扣。这种方法计算简单，但可能导致企业的税负相对较高。因此，企业在选择计税方式时，需综合考虑自身的规模、销售额及成本等因素，以选择最合适的计税方法。

企业所得税计算

企业所得税是根据企业的年度利润来计算的。利润就是你的收入减去成本、费用和税金。软件企业的收入总额是指《企业所得税法》第六条规定的收入总额，获利年度是指软件企业开始生产经营后，第一个应纳税所得额大于零的纳税年度。

企业所得税的税率一般为25%，但若为非居民企业在中国境内未设立机构、场所的，或者虽设立机构、场所但取得的所得与其所设机构、场所没有实际联系的，就其来源于中国境内的所得，适用税率为20%。

其他税种

城建税和教育费附加：这些税费通常基于实际缴纳的增值税来计算。例如，应交城建税=实际缴纳的增值税×7%，应交教育费附加=实际缴纳的增值税×3%。

营业税：如果企业提供技术服务，可能需要缴纳营业税，税率通常为5%。附加税如城建税和教育费附加的计算方式与增值税类似。

税收优惠

软件企业可以享受一些税收优惠政策，如高新技术企业的税收优惠等。这些优惠政策可以在计算应纳税所得额时降低税负。

申报与缴纳

软件公司需要定期进行税务申报，包括增值税和企业所得税的申报。申报过程中，企业需要提交相关的财务报表和税务申报表，并按照税务局的要求缴纳相应的税款。

建议

选择合适的计税方法：软件公司应根据自身的规模、销售额及成本等因素，选择最合适的增值税计税方法。

合理规划税务：企业应合理规划税务，确保税务申报和缴纳的准确性和及时性，避免因税务问题影响企业的正常运营。

充分利用税收优惠政策：软件企业应充分了解并利用国家提供的税收优惠政策，降低税负，提高企业的整体盈利能力。