企业软件开发交税的方式主要包括以下几种：

企业所得税

税率：一般纳税人通常为6%、9%或13%，具体取决于所提供的服务或销售的商品种类；小规模纳税人税率为3%。

计算方式：企业所得税是企业在经营过程中，根据利润水平需要缴纳的一种税种。计算公式为：应纳税所得额乘以适用税率减去速算扣除数。应纳税所得额等于企业的收入总额减去准予扣除的项目后的余额。

优惠政策：高新技术企业可以享受减按15%的优惠税率征收企业所得税。此外，研发费用加计扣除政策允许企业在计算应纳税所得额时，将研发费用按一定比例加计扣除，具体比例可能为75%或100%。

增值税

税率：一般纳税人适用13%或6%的税率，小规模纳税人适用3%的简易征收率。

计算方式：增值税的计算方式为销项税额减去进项税额。销项税额是企业在销售商品或提供服务时收取的增值税，进项税额是企业在购买商品或服务时支付的增值税。一般纳税人可以抵扣进项税额，而小规模纳税人不能。

优惠政策：软件产品增值税即征即退政策，对于销售自产软件产品的企业，实际税负超过3%的部分可以申请即征即退。

个人所得税

税率：采用超额累进税率，分为3%、10%、20%、25%、30%、35%和45%七档。

计算方式：应纳税所得额乘以适用税率减去速算扣除数。应纳税所得额等于员工的收入减去五险一金和其他法定扣除项目。

企业责任：企业作为扣缴义务人，需要按月或按次代扣代缴员工的个人所得税。

附加税费

城建税：根据纳税人所在地的不同，税率通常为7%、5%或1%。

教育费附加和地方教育费附加：通常按照增值税的一定比例缴纳，例如教育费附加为3%，地方教育费附加为2%。

印花税：合同按金额的万分之三贴花。

其他税种

房产税、 车船税等。

缴税流程：

税务登记 ：企业成立初期必须完成税务登记，获得税务局的税号，从而合法地进行纳税申报。税务登记需要提供一系列资料，包括营业执照、法人身份证、公司章程等。

增值税申报：

企业需要按月或按季度申报增值税，并在规定时间内缴纳税款。一般纳税人需要开具增值税专用发票并进行增值税抵扣，小规模纳税人则适用简易计税方法。

企业所得税预缴：

企业需要按季预缴企业所得税，并在年度终了后进行汇算清缴。

个人所得税代扣代缴：

企业在发放工资时，先计算并扣除应缴的个人所得税，再将剩余部分支付给员工。

建议

合理规划税务策略：企业应根据自身业务性质和销售额确定是否适用一般纳税人或小规模纳税人，并合理利用税收优惠政策，如研发费用加计扣除等，以降低税务负担。

保持准确记录：企业需要保存好所有相关的财务记录和发票，以便在申报纳税时能够提供准确的信息，避免滞纳金和罚款。

及时申报：企业应按时进行增值税、企业所得税和个人所得税的申报和缴纳，以确保合法合规。