定量PCR（qPCR）分析软件有多种，每种软件都有其独特的功能和适用场景。以下是一些主要的qPCR分析软件及其特点：

Applied Biosystems DataAssist™ 软件

功能：适用于实时荧光定量PCR（qPCR）仪器的数据分析，包括相对基因表达定量、等位基因簇分析、CNV拷贝数测定和HRM曲线生成等。

特点：易于使用，采用比较Ct （ΔΔCt） 法进行快速、准确的定量分析，且为免费工具。

Rotor-Gene3000软件

功能：以标准曲线对未知样品进行定量，支持实时分析和结果更新。

特点：可在反应进行过程中或结束后进行分析，提供即时的结果反馈。

LightCycler®480 II软件

功能：支持绝对定量、熔解曲线分析、相对定量和自动基因分型等功能。

特点：设计宗旨为满足用户需求，具有高准确度和自动化程度，适合多种qPCR应用。

HID 实时 PCR 分析软件 v1.3

功能：优化法医学实验室的定量工作流程，增强下游决策过程，支持虚拟标准曲线、可定制模板和高级数据分析功能。

特点：专为配合Applied Biosystems 7500和QuantStudio 5实时PCR系统使用而设计，简化实验构建，增强数据分析和审查过程。

荧光定量PCR分析服务

功能：基于高通量荧光定量PCR的生物数据分析，提供数据标准化、Ct值确定、相对定量计算和统计分析等功能。

特点：输入界面简单方便，模块功能强大，操作流程简便易懂，支持多种结果分析图。

其他通用软件

功能：一般PCR仪自带的软件用于数据收集和分析，包括查看扩增曲线、调整基线和阈值、相对定量计算等。

特点：虽然方便，但需要对原始数据进行检查和再分析，以评估数据质量和可靠性。

建议

选择合适的qPCR分析软件应根据具体实验需求、仪器类型和数据分析的复杂性来决定。对于需要高通量、高准确度和自动化分析的场景，可以考虑使用Applied Biosystems的DataAssist™、LightCycler®480 II或HID 实时 PCR 分析软件。对于一般实验室，使用PCR仪自带的软件或通用分析服务可能更为便捷。无论选择哪种软件，都应确保对原始数据进行适当的质量控制和验证，以获得可靠的分析结果。