软件著作应包括以下内容：

软件代码

包括源代码、目标代码和编程时的指令集，是软件著作的核心部分。

设计文档

描述软件的设计思路、架构及功能模块等，是软件开发的蓝图。

用户手册

为用户提供操作指南，包括软件安装、使用方法和常见问题解答等。

测试报告

记录软件开发的测试过程及结果，确保软件的质量和稳定性。

软件著作权信息

包括软件名称、版本号、开发完成日期、软件开发情况（独立开发、合作开发、委托开发、下达任务开发等）。

著作权人信息，可以是个人或单位，或者单位+个人合作开发。

权利范围，包括发表权、署名权、修改权、复制权、发行权、出租权、信息网络传播权等。

软件鉴别材料

包括软件源代码和软件著作权说明书，确保软件的唯一性和合法性。

其他必要信息

软件的软硬件开发环境和软件的功能及技术要求。

软件的流程图、函数说明、模块说明、数据接口、出错设计等。

建议在编写软件著作时，确保所有内容都符合相关法律法规的要求，并且能够全面、准确地反映软件的功能和开发过程，以便在申请软件著作权时能够顺利通过审核。