制作系统结构框图的软件有多种选择，以下是一些常用的软件：

Microsoft Visio

特点：Visio是微软公司出品的一款强大的图形创建与编辑工具，界面设计直观，用户可以通过拖放操作快速创建各种图形，如流程图、组织结构图、网络图、UML图等。Visio提供了丰富的模板和形状库，并支持数据导入和与Microsoft SharePoint、SQL Server等企业级应用的集成。

适用场景：适用于需要高效创建和编辑复杂图形的专业人士，尤其是与微软生态系统集成的场景。

Lucidchart

特点：Lucidchart是一款基于云端的图形设计工具，用户可以通过浏览器访问和使用。它支持多人实时协作，并提供了丰富的模板和形状库，适用于创建和共享系统结构图。

适用场景：适用于需要远程协作和实时更新的团队，尤其是跨地域的项目。

Draw.io

特点：Draw.io是一款免费的在线绘图工具，用户可以通过浏览器直接使用。它支持多种图形的绘制，包括系统结构框图，并且易于分享和协作。

适用场景：适用于个人用户或小型团队，需要快速创建和分享简单图形。

OmniGraffle

特点：OmniGraffle是Mac平台上的专业绘图工具，以其简洁的界面和强大的功能著称。它提供了丰富的模板和形状库，适用于创建高质量的图形，包括系统结构框图。

适用场景：适用于Mac用户，需要高质量的图形设计和编辑。

Edraw Max

特点：Edraw Max是一款功能强大的绘图软件，提供了大量的模板和形状库，支持多种文件格式，适用于创建和编辑各种图形，包括系统结构框图。

适用场景：适用于需要创建复杂图形和图表的专业人士和团队。

Balsamiq Mockups

特点：Balsamiq Mockups是一款基于云端的UI/UX设计工具，主要用于创建原型图，但也可以用于绘制系统结构框图。它支持多人协作和实时同步。

适用场景：适用于UI/UX设计师，需要快速创建和分享原型图。

Creately

特点：Creately是一款在线绘图工具，提供了丰富的模板和形状库，支持多种图形的绘制和编辑，包括系统结构框图。它也支持实时协作和分享。

适用场景：适用于个人用户和团队，需要快速创建和分享图形。

根据你的具体需求，可以选择适合的软件来制作系统结构框图。如果你已经在使用微软的Office套件，Visio可能是最方便的选择。如果你需要云端协作和实时更新，Lucidchart或Draw.io可能更适合你。如果你需要高质量的图形设计和编辑，OmniGraffle或Edraw Max可能是更好的选择。