根据教育部公布的第四轮学科评估结果，国内软件工程专业最好的大学如下：

北京航空航天大学

软件工程学科评估结果为A+，综合教学实力全国第一。

浙江大学

软件工程学科评估结果为A+，综合教学实力全国第一。

国防科技大学

软件工程学科评估结果为A+，综合教学实力全国第一。

北京大学

软件工程学科评估结果为A，办学水平全国第二。

清华大学

软件工程学科评估结果为A，办学水平全国第二。

华东师范大学

软件工程学科评估结果为A，办学水平全国第三。

南京大学

软件工程学科评估结果为A，办学水平全国第四。

武汉大学

软件工程学科评估结果为A，办学水平全国第五。

这些学校在国内软件工程专业的教学和科研实力上均处于领先地位，是同学们在择校时的优先选择。建议根据自己的兴趣和职业规划，综合考虑学校的地理位置、学科特色、师资力量和就业情况，选择最适合自己的学校。