软件的限制主要包括以下几个方面：

适用范围明确性

软件应明确界定其适用人群、适用疾病或症状范围，以及不适用于哪些情况。例如，眼科诊断软件应说明适用于哪些眼科疾病的诊断辅助，以及适用的患者年龄范围和眼部生理状态等。

技术限制分析

软件在技术方面的限制，如对输入数据的要求（数据格式、分辨率、采样频率等），以及在处理能力、算法模型等方面的局限性。例如，医学影像处理软件可能要求输入的影像必须为特定格式，且分辨率不低于一定标准。

软件著作权限制

合理使用：在特定条件下，他人可以不经软件著作权人许可，不向其支付报酬而使用软件，例如为了学习和研究软件内含的设计思想和原理。

法定许可使用：依据法律的明确规定，在某些特定情形下，使用者可以不经著作权人许可使用其软件，但应当支付报酬。

时间限制：自然人的软件著作权保护期为自然人终生及其死亡后50年，法人或其他组织的软件著作权保护期为50年。

侵权限制：在保护期内，由于课堂教学、科学研究、国家机关执行公务等非商业目的，软件可以少量复制，未经软件所有者同意，不得支付报酬。

报酬限制：在保护期内，国务院有关主管部门和省、自治区、直辖市人民政府有权决定指定的单位使用，由上级单位或者政府部门发布的任务开发，对国家利益和公共利益具有重要意义的软件，用户有权按照国家有关规定支付使用费。

未经作权人同意的限制：合法持有软件复制品的单位和公民可以不经软件著作权人同意，根据使用需要将软件装入计算机、备份复制品存档、进行必要的修改等。

其他限制

软件著作权人不得损害公众利益，违反其他法律。

软件复制品合法持有人在不经软件著作权人同意的情况下，可以根据使用的需要把该软件装入计算机内，制作备份复制品，进行必要的修改等。

这些限制旨在平衡软件著作权人的合法权益和公众利益，促进软件知识的传播和应用。