软件销售收入的退税流程主要涉及以下几个步骤：

税务登记与资质获取

确保企业已按照国家规定完成税务登记，并取得相关资质，如软件产品登记证书或计算机软件著作权登记证书。

软件产品登记与认定

在软件产品开发完成后，及时向税务部门申请软件产品登记和认定。

会计核算与凭证保留

按照税法规定，将符合条件的软件销售收入进行会计核算，并保留相关凭证和资料。

增值税申报

在增值税纳税申报表中，软件产品的销售额和销项税额需单独列示。嵌入式软件需分别列明硬件和软件的销售额。

即征即退申请

填写《增值税即征即退申请表》，并附上以下材料：

软件产品登记证书或软件著作权登记证书。

销售合同、发票复印件。

纳税申报表及完税凭证。

部分地区可能要求提供软件产品成本核算资料。

电子税务局申请退税

完成增值税申报后，在电子税务局申请退税，按照系统提示操作，提交所需材料，等待审核通过后即可获得退税。

退税材料审核与备案

准备相关资料到税务窗口办理“软件产品增值税即征即退资格备案”手续，包括税务资格备案表、软件产品检测报告等。

大厅退税申请

在次月申报期内申报增值税后，向税政科预约递交退税资料，等待审核通过后，准备相关资料到办税大厅办理退税申请。

退税款项处理

取得的即征即退增值税款如专用于软件研发和扩产，并单独核算，可以作为不征税收入，从收入总额中减除，不需缴纳企业所得税。

通过以上步骤，软件企业可以有效地进行退税操作，减轻税务负担。建议在实际操作中，企业应确保所有材料和手续的准确性和完整性，以便顺利完成退税流程。