软件公司可以通过以下措施来保护自己的版权和知识产权：

采用授权方式 ：通过授权软件销售和分发，虽然难以完全避免盗版，但可以控制软件的使用范围和传播渠道。

盗版软件检测：

使用专业的盗版软件检测工具，及时发现并打击盗版行为，保护公司的版权和收益。

技术保护

加密技术：

对软件源代码和关键数据进行高强度加密，防止未经授权的复制和访问。

虚拟桌面技术：通过虚拟桌面技术，使代码只在服务器端存储，终端操作不保存代码，减少数据泄露风险。

访问控制：建立严格的访问控制机制，对不同层级的员工设置不同的访问权限，确保只有授权人员才能接触敏感信息。

网络安全：安装防火墙和入侵检测系统，保护网络不受攻击，确保数据传输的安全性。

法律手段

申请软著和专利：对核心技术进行专利申请和软件著作权登记，确保知识产权的法律保护。

保密协议：与员工签订保密协议，明确保密义务和责任，对违约行为进行处罚。

合同约束：在与外部合作方签订合同时，明确保密条款和违约责任，追究泄密者的法律责任。

内部管理

保密培训：加强员工的保密意识培训，使其认识到商业秘密的重要性，培养职业道德和保密习惯。

定期审计：定期对内部保密制度和技术保护措施进行评估和改进，发现并修复潜在的安全漏洞。

知识产权管理

建立管理制度：制定明确的知识产权管理制度，控制和管理知识产权保护方面的资料，确保企业在技术发展中的优势。

设置管理机构：设立专门的知识产权部门，负责软件立项、开发、销售及售后服务中的法律保障工作。

通过综合运用上述措施，软件公司可以更有效地保护自己的版权和知识产权，确保在激烈的市场竞争中立于不败之地。