软件招标审计的主要内容包括以下几个方面：

招标准备工作审计

审查招标项目的审批手续和资金落实情况。

审查招标所采用的形式（公开招标、邀请招标等）及其合规性。

审查招标内容的合规性、合法性以及与招标方式相关规定的一致性。

招标文件审计

审查招标人是否按规定编制了招标文件，发布了招标公告或发出招标邀请书。

审查招标文件的修改和补充是否按有关规定进行。

审查招标文件中所列示的评标要求及评标标准的合理性、规范性。

审查招标文件与招标通知书的一致性。

标底价的审计

标底是招标人对所要招标设备物资的预期价格，其制定是招投标工作中的重要环节。

审计标底的合理性和公允性。

招标工作具体实施情况审查

采用公开招标方式的，审查对外发布的招标信息是否全面、准确，发布范围是否具有广泛性，参与招标的投标人是否合格。

采用邀请招标的，审查接受邀请的投标单位是否具有良好信誉、资质和财务状况，是否邀请至少三个以上投标人参加。

采用议标采购方式的，判断其合理性，审查是否经过相关部门评审。

审查保证金是否按招标文件规定收取和退还，开标过程有无记录，开标是否遵照招标文件规定时间和地点进行，是否存在二次报价的情况。

投标审计

审计机构对企业经营环境及审计风险进行评估。

企业按照材料清单，提早做好前期准备，如企业背景资料、经营资料等。

审计机构组建审计工作小组，对企业经营环境及状况进行深入了解，并以此为依据制定具体审计工作计划。

审计人员入场，对企业开展投标审计，同时对期间发现的问题和线索进行详细记录，形成审计工作底稿。

整理工作底稿，并对记录的问题进行复核，然后出具投标审计报告。

其他注意事项

选择合规优质的事务所进行审计，确保审计工作的质量和效率。

招标文件中通常会要求提供完整的招投标审计报告，或者资产负债表、利润表、现金流量表等。

注意招标文件的合规合法性，避免违法违规条款。

通过以上步骤，可以确保软件招标过程的公平、公正和透明，从而提高招标的质量和效率。建议在实际操作中，结合具体情况，灵活运用相关审计方法和工具，确保审计工作的全面性和深入性。